Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phc3Q8CHP6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phc3Q8CHP6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.1 ms