Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim32Q8CH72 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trim32Q8CH72 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trim32Q8CH72 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms