Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx8Q8CFD4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Snx8Q8CFD4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Snx8Q8CFD4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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