Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
9030612E09RikQ8CE20 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
9030612E09RikQ8CE20 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms