Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc87Q8CDL9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc87Q8CDL9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc87Q8CDL9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms