Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fbxo43Q8CDI2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms