Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Riox2Q8CD15 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Riox2Q8CD15 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Riox2Q8CD15 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms