Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Phf20l1Q8CCJ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Phf20l1Q8CCJ9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Phf20l1Q8CCJ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms