Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nhlrc3Q8CCH2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nhlrc3Q8CCH2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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