Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8CCC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CCC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CCC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q8CCC3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q8CCC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms