Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrn3Q8CBC6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrn3Q8CBC6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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