Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn5Q8CBA2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms