Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fbxo48Q8CAT8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms