Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhe22Q8C6A8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms