Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot2Q8C5L3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot2Q8C5L3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot2Q8C5L3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot2Q8C5L3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot2Q8C5L3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cnot2Q8C5L3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cnot2Q8C5L3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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