Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8C5C9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C5C9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8C5C9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C5C9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8C5C9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms