Protein–RNA interactions for Protein: Q8C561

Lmbrd2, LMBR1 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd2Q8C561 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbrd2Q8C561 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbrd2Q8C561 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbrd2Q8C561 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms