Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc60Q8C4J0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc60Q8C4J0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc60Q8C4J0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms