Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rft1Q8C3B8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rft1Q8C3B8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rft1Q8C3B8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms