Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf428Q8C1M2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf428Q8C1M2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf428Q8C1M2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms