Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csgalnact2Q8C1F4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Csgalnact2Q8C1F4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csgalnact2Q8C1F4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms