Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim47Q8C0E3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim47Q8C0E3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim47Q8C0E3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms