Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FarsaQ8C0C7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FarsaQ8C0C7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FarsaQ8C0C7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms