Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccser1Q8C0C4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccser1Q8C0C4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccser1Q8C0C4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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