Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctdsp2Q8BX07 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctdsp2Q8BX07 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms