Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab11fip4Q8BQP8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab11fip4Q8BQP8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms