Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQC3

Igdcc3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc3Q8BQC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Igdcc3Q8BQC3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Igdcc3Q8BQC3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Igdcc3Q8BQC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms