Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E130116L18RikQ8BMV6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms