Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab3gap2Q8BMG7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rab3gap2Q8BMG7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rab3gap2Q8BMG7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms