Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY7

Hps6, Hermansky-Pudlak syndrome 6 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps6Q8BLY7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hps6Q8BLY7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hps6Q8BLY7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hps6Q8BLY7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms