Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gpc2Q8BKV1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gpc2Q8BKV1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gpc2Q8BKV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms