Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV0

Spock3, Testican-3, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock3Q8BKV0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spock3Q8BKV0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Spock3Q8BKV0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms