Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tspan12Q8BKT6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tspan12Q8BKT6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tspan12Q8BKT6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms