Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKE9

Ift74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift74Q8BKE9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ift74Q8BKE9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ift74Q8BKE9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ift74Q8BKE9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms