Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp1Q8BJQ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp1Q8BJQ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp1Q8BJQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms