Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prune1Q8BIW1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prune1Q8BIW1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prune1Q8BIW1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms