Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rufy1Q8BIJ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rufy1Q8BIJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms