Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbxo28Q8BIG4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbxo28Q8BIG4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo28Q8BIG4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms