Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slfnl1Q8BHW9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slfnl1Q8BHW9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slfnl1Q8BHW9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slfnl1Q8BHW9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slfnl1Q8BHW9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slfnl1Q8BHW9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms