Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp4f39Q8BGU0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp4f39Q8BGU0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp4f39Q8BGU0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms