Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Best2Q8BGM5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Best2Q8BGM5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms