Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrrtm2Q8BGA3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrrtm2Q8BGA3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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