Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sh3bgrl2Q8BG73 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sh3bgrl2Q8BG73 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms