Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NfascQ810U3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NfascQ810U3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NfascQ810U3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms