Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc172Q810N9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc172Q810N9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc172Q810N9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc172Q810N9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms