Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39bQ810L4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39bQ810L4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmem39bQ810L4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms