Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pcsk9Q80W65 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pcsk9Q80W65 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pcsk9Q80W65 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms