Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Polr2eQ80UW8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Polr2eQ80UW8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Polr2eQ80UW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms