Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ7

Rab3gap1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap1Q80UJ7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab3gap1Q80UJ7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rab3gap1Q80UJ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms