Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RubcnQ80U62 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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RubcnQ80U62 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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RubcnQ80U62 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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RubcnQ80U62 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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RubcnQ80U62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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RubcnQ80U62 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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RubcnQ80U62 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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RubcnQ80U62 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RubcnQ80U62 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RubcnQ80U62 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms